（一）办公室。负责机关日常运转工作，承担信息、安全、保密、信访、政务公开、信息化、新闻宣传等工作。承担机关行政应诉等工作。编纂周口科技史志。承担市科技创新委员会办公室日常工作。
（二）人事与财务科。承担机关和所属单位的干部人事、机构编制、工资和队伍建设等工作。负责机关财务、预决算和内部审计工作。负责离退休干部工作。负责机关党建工作。
（三）先进制造与电子信息科。负责新型显示和智能终端、大数据、新一代人工智能、网络安全、网络与通信、先进计算、区块链、软件、重大装备、智能装备与机器人、制造共性技术及关键基础件、智能传感器,工业互联网等相关产业领域的科技需求分析和技术预测，拟订相关产业发展科技专项规划、年度计划、政策并协调组织实施;推动本领域技术攻关，提出重大（重点）任务并协调组织实施，推进本领域科技成果转化；提出本领域实验室、平台基地、人才团队、产业技术创新联盟、创新联合体等建设计划；加强培育发展本领域科技企业，形成高科技领军企业、高新技术企业、科技型中小企业梯次发展格局。组织开展应用基础研究发展预测和需求分析，拟订全市应用基础研究规划、政策并组织实施，组织实施应用基础研究；协助实施省级以上自然科学基金项目。
（四）生物医药与科普科。负责生命健康、生物医药、中医药现代化、医疗器械、资源综合利用、大气（水、土壤）污染防治、节能减排、绿色低碳等绿色技术、淮河流域生态保护及修复、公共安全及其他社会事业等相关产业领域的科技需求分析和技术预测，拟订相关产业发展科技专项规划、年度计划、政策并协调组织实施。推动本领域技术攻关，提出重大（重点）任务并协调组织实施，推进本领域科技成果转化；提出本领域实验室、平台基地、人才团队、产业技术创新联盟、创新联合体等建设计划；加强培育发展本领域科技企业，形成高科技领军企业、高新技术企业、科技型中小企业梯次发展格局；承担临床医学研究中心建设工作；负责生物科技安全相关工作。会同有关部门拟订全市科技人才队伍建设规划和政策措施，组织实施科技人才计划，推动全市创新型科技人才和团队建设，建立健全科技人才评价和激励机制；负责本市两院院士培育和支持等工作，承担院士工作站、中原学者科学家工作室、中原学者工作站服务与管理。拟定全市科学普及和科学传播规划、政策并组织实施。
（五）农村科技与平台建设科。负责种业创新、农业丰产绿色高效种植、动物健康养殖、智慧农业、农产品加工、现代食品制造等相关产业领域的科技需求分析和技术预测，拟订相关产业发展科技专项规划、年度计划、政策并协调组织实施；推动本领域技术攻关，提出重大（重点）任务并协调组织实施，推进本领域科技成果转化；提出本领域实验室、平台基地、人才团队、产业技术创新联盟、创新联合体等建设计划；加强培育发展本领域科技企业，形成高科技领军企业、高新技术企业、科技型中小企业梯次发展格局；指导农业农村科技进步和县域创新驱动发展工作，组织实施科技特派员计划，推动科技支撑乡村振兴和农业科技社会化服务体系建设；协调指导农业高新技术产业示范区、农业科技园区管理工作。提出重大科技创新基地和科研条件保障建议并监督实施；协调推进全市科技基础设施建设，统筹布局市（重点）实验室、工程技术研究中心、新型研发机构、技术创新中心、中试基地等建设；组织协调创建省级以上（重点）实验室、工程技术研究中心、新型研发机构、技术创新中心、中试基地等创新平台；推进科技资源和科学数据开放共享。
（六）新材料与企业服务科。负责生物降解材料、有机高分子材料、无机非金属材料、先进电子材料、先进金属材料、新型建材、现代轻纺、动力电池、氢能与燃料电池、可再生能源、先进储能、新能源汽车、汽车及零部件等相关产业领域的科技需求分析和技术预测，拟订相关产业发展科技专项规划、年度计划、政策并协调组织实施;推动本领域技术攻关，提出重大（重点）任务并协调组织实施，推进本领域科技成果转化；提出本领域实验室、平台基地、人才团队、产业技术创新联盟、创新联合体等建设计划；加强培育发展本领域科技企业，形成高科技领军企业、高新技术企业、科技型中小企业梯次发展格局。牵头组织企业技术创新相关工作，协调推进创新联合体、产业技术创新联盟建设，提出激励企业技术创新的政策措施；拟订科技金融结合的政策措施并组织实施。引导社会资源支持科技创新，会同有关部门指导科技投融资及相关中介服务工作；研究提出促进科技创新创业和科技服务业发展的政策措施，推动科技服务体系建设和科技中介组织发展；牵头负责高新技术企业和科技型中小企业培育工作；负责科技企业孵化等创新创业工作。
（七）项目统筹与法规科。拟订全市科技创新发展战略、规划并协调组织实施；组织创新驱动发展战略重大问题研究和技术预测，承担全市重大科技决策咨询制度运行工作；协调推进全市科技创新体系建设和科技体制改革，拟订科研机构改革发展规划和政策并监督实施；承担相关地方性法规和规章草案起草工作；负责机关规范性文件合法性审查和清理工作；组织实施科技创新调查；承担科技统计相关工作，组织开展软科学研究，负责军民科技协同创新融合发展、科技保密、科技安全和技术出口审查相关工作；统筹产业科技创新工作；承担周口市国防动员委员会科技动员办公室日常工作。统筹提出科技资源合理配置的政策措施建议，组织编制实施财政科技计划（专项）；承担建设运行全市科技管理信息系统，建立科研项目资金协调、评估、监管工作机制；指导项目管理专业机构建设和运行；实施科技报告制度。
（八）成果转化与区域创新科。拟订全市科技成果转化地方性政策并监督实施；提出科技成果转移转化及产业化、促进政产学研用深度融合和科技知识产权创造的相关政策措施建议；开展全市技术转移体系建设；承担技术市场管理相关工作。指导县域和开发区创新科技工作；协调推动创新型城市建设工作；指导协调高新技术产业开发区建设；承担厅市会商相关工作。拟订引进国外智力规划；负责引进国外人才；拟订在周工作外国专家管理办法，推动建立外国科学家、团队吸引集聚机制和重点外国专家联系服务机制，承担重点外国专家服务工作。拟订科技对外交往、科技交流及创新能力开放合作的规划、措施并推动落实；负责全市对外及涉港澳台地区科技合作与交流工作；加强与其他地市科技合作与交流；协调促进高等院校、科研机构与地方产业发展的合作融合；受市政府委托，负责科技人员及科技团组出国（境）日常管理。
（九）科技监督与诚信建设科。承担科技监督评价体系建设和科技评估管理相关工作，提出科技评价机制改革的政策措施建议并监督实施，开展科技绩效评价和监督检查工作，指导科技评估机构建设；承担科研诚信建设工作。监督检查科技计划和专项经费使用情况；拟订科技奖励地方性法规、政策和制度并组织实施，推动全市科技奖励改革；负责全市科技奖励工作，承担省科学技术奖提名，负责周口市科学技术奖的组织评审，指导全市社会科技奖励工作。